Die regionalen Regierungskonferenzen befassen sich in erster Linie mit Geschäften von regionaler Bedeutung. Es gibt viele Bereiche, in denen ein Zusammenschluss mehrerer Kantone bessere Ergebnisse erzielt, ohne dass diese von gesamtschweizerischem Interesse sind und bundesweit behandelt werden müssen.
Das KdK-Sekretariat pflegt einen regelmässigen Austausch mit den Sekretariaten der regionalen Regierungskonferenzen.